Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copb2O55029 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms