Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SlkO54988 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SlkO54988 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SlkO54988 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SlkO54988 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SlkO54988 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms