Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EdaO54693 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EdaO54693 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EdaO54693 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EdaO54693 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EdaO54693 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EdaO54693 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EdaO54693 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EdaO54693 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EdaO54693 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms