Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FxnO35943 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FxnO35943 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FxnO35943 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FxnO35943 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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