Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc1O35914 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc1O35914 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms