Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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