Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc1a6O35544 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms