Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna4O35343 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna4O35343 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms