Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2O35245 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms