Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nedd9O35177 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms