Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra3O35118 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms