Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scarb2O35114 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Scarb2O35114 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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