Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms