Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms