Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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