Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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BC117090L7N257 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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