Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC024978J3QPC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC024978J3QPC3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms