Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm20828J3KMI7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm20828J3KMI7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm20828J3KMI7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20828J3KMI7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20828J3KMI7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20828J3KMI7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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