Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf4bG5E8Z2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms