Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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