Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms