Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms