Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r76F8VQ63 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms