Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms