Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms