Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8444F6XS56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms