Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm340F6RGI3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms