Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Herc6F2Z461 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herc6F2Z461 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms