Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnmb3E9Q7U0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnmb3E9Q7U0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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