Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5N9

Zfp395, Zinc finger protein 395, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp395E9Q5N9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp395E9Q5N9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp395E9Q5N9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms