Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20518E9Q548 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms