Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc171E9Q1U1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms