Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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