Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms