Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms