Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cngb1E1AZ71 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cngb1E1AZ71 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cngb1E1AZ71 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cngb1E1AZ71 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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