Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhl3E0CZ16 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhl3E0CZ16 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms