Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
BC035044E0CXF8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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