Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms