Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SafbD3YXK2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SafbD3YXK2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms