Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc13D3YV10 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms