Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3259D3YUK0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3259D3YUK0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms