Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ube2d4D3YUH6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms