Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx8D3YU81 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx8D3YU81 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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