Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smok3bC0HKC9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms