Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Usf3B2RUQ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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