Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem235B1AQL3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem235B1AQL3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms