Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprsB0V2N1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms