Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms