Protein–RNA interactions for Protein: A6H584

Col6a5, Collagen alpha-5(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a5A6H584 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Col6a5A6H584 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col6a5A6H584 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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